1.股份制改造阶段
拟在新三板市场挂牌的企业需成立满两年，目前若还尚归属于有限企业的公司需进行股改，选聘中介机构，在其认真审计净资产值后选定股改基准日后整体变更为股份公司，因为新三板市场主要以非上市股份有限企业为主。股份公司需要依法设立且存续满两年。除此之外，变更后的股份公司应该有清晰的业务发展战略目标，减少和规范关联交易，产权关系清晰，有完整的业务体系和持续经营能力以及突出的主营业务和核心竞争力等等。
2.材料制作准备阶段
申请新三板市场挂牌的企业应当按照规定进行材料制作准备的工作，其中包括：公司董事会、股东大会决议；签订推荐挂牌协议，委托一家主办券商作为其推荐主办券商；制作挂牌申请文件；积极配合主办券商的调查工作；由主办券商报送推荐挂牌备案文件，该工作由券商牵头，公司、会计师、律师共同配合完成。
3.机构审核反馈阶段
在上一个阶段中已经提到主办券商会报送企业的推荐挂牌备案文件，在此阶段，将由交易所，即（全国股份转让系统公司）与证监会审查报送的备案文件并作出是否备案的决定，该阶段也是企业在新三板挂牌的决定性阶段。如对推荐挂牌备案文件无异议，自受理之日起五十个工作日内就会向推荐主办券商出具备案确认函。反之，如果对推荐挂牌备案文件有异议，可向主办券商书面或口头提出反馈意见；若经过多次反馈仍有异议的且最终决定不予备案的，以出具书面通知以及说明原因的方式告知主办券商。
4.挂牌登记阶段
该阶段是在通过全国股转系统公司审查之后同意进行挂牌阶段，由主办券商带领和协助企业进行。该阶段需要做的工作有：分配股票代码；办理股份登记存管；公司挂牌敲钟。
